Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms