Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffaO54786 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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DffaO54786 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffaO54786 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DffaO54786 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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