Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CckarO08786 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CckarO08786 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CckarO08786 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CckarO08786 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CckarO08786 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CckarO08786 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CckarO08786 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CckarO08786 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
CckarO08786 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CckarO08786 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CckarO08786 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms