Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MttpO08601 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MttpO08601 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MttpO08601 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms