Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3278L7N2D2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms