Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm8356J3QPD3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms