Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC024978J3QPC3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC024978J3QPC3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC024978J3QPC3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BC024978J3QPC3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC024978J3QPC3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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