Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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4930544D05RikJ3QK56 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
4930544D05RikJ3QK56 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
4930544D05RikJ3QK56 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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4930544D05RikJ3QK56 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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4930544D05RikJ3QK56 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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4930544D05RikJ3QK56 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930544D05RikJ3QK56 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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4930544D05RikJ3QK56 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930544D05RikJ3QK56 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4930544D05RikJ3QK56 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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