Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm8005F6YKY3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm8005F6YKY3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm8005F6YKY3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm8005F6YKY3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm8005F6YKY3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm8005F6YKY3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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