Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20518E9Q548 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20518E9Q548 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20518E9Q548 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20518E9Q548 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20518E9Q548 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20518E9Q548 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20518E9Q548 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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