Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm17727E9Q4V7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm17727E9Q4V7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm17727E9Q4V7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm17727E9Q4V7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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