Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Krt78E9Q0F0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms