Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc6D3YZP9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc6D3YZP9 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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