Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AU015836B2RUM3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AU015836B2RUM3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms