Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem235B1AQL3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem235B1AQL3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem235B1AQL3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem235B1AQL3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem235B1AQL3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms