Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn6A2AJB9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Lcn6A2AJB9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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