Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pramel3A2AHA7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms