Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms