Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm17190V9GX38 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm17190V9GX38 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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