Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac5Q9Z2V6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac5Q9Z2V6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac5Q9Z2V6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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