Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.7 ms