Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Cldn8Q9Z260 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms