Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam50bQ9WTJ8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam50bQ9WTJ8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms