Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek3Q9R0A5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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