Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Rnf4Q9QZS2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rnf4Q9QZS2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf4Q9QZS2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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