Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PdcQ9QW08 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms