Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hmgn5Q9JL35 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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