Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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