Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ush1cQ9ES64 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ush1cQ9ES64 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms