Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gtf3c6Q9D8P7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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