Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rep15Q9D7T1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms