Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn23Q9D7D7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms