Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms