Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc7Q9D541 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc7Q9D541 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms