Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lonrf3Q9D4H7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lonrf3Q9D4H7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lonrf3Q9D4H7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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