Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hddc3Q9D114 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms