Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Tmem88Q9D0N8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem88Q9D0N8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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