Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Zbed3Q9D0L1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbed3Q9D0L1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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