Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms