Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Cnot11Q9CWN7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnot11Q9CWN7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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