Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms