Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcf1Q9CTH6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms