Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pard3bQ9CSB4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms