Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q9CRC3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q9CRC3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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