Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Ifitm3Q9CQW9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifitm3Q9CQW9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms