Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
RetnQ99P87 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms