Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PtprtQ99M80 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PtprtQ99M80 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PtprtQ99M80 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PtprtQ99M80 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PtprtQ99M80 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PtprtQ99M80 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprtQ99M80 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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