Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lactb2Q99KR3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms