Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps4Q99KG7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms