Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms